Enfeksiyon Hastalıkları Anabilim Dalı Araştırma Laboratuvarında yürütülen araştırmalar genel olarak aşağıdaki başlıklar altında toplanabilir: 

• Antimikrobiyal direnç sürveyans çalışmaları: Toplum kaynaklı enfeksiyon etkenleri ( Escherichia coli,  Streptococcus pneumoniae, Neisseria gonorrhoeae) ile yoğun bakım ve/veya hastane enfeksiyonu etkenleri bakterilerin ( karbapeneme dirençli enterik bakteriler, Pseudomonas aeruginosa ve Acinetobacter baumannii, metisiline dirençli Staphylococcus aureus, vankomisine dirençli Enterococcus faecium) yeni ve/veya kullanımda olan antimikrobiyallere in-vitro aktivitelerinin araştırılması. Tedavisi güç enfeksiyon etkenlerine karşı farklı antimikrobiyal kombinasyonların in-vitro sinerjik etkilerinin araştırılması.
• Hastane enfeksiyonlarının laboratuvar sürveyansı: Hastane enfeksiyonları kontrol komitesi yönetiminde hastalarda hastane enfeksiyonu etkeni çeşitli bakterilerin ( karbapeneme dirençli enterik bakteriler, karbapeneme dirençli Pseudomonas aeruginosa ve Acinetobacter baumannii, metisiline dirençli Staphylococcus aureus, vankomisine dirençli Enterococcus faecium) taranması, taramada uygun tanı yöntemlerinin kıyaslanması. Hastane enfeksiyonları salgınlarında etken bakterilerin çeşitli moleküler teknikler (ap-PCR, PFGE) ile epidemiyolojik analizi.
• Cinsel yolla bulaşan enfeksiyon etkenleri ile ilgili çalışmalar: Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis, Trichomonas vaginalis, Mycoplasma genitalium saptanması, tanı yöntemlerinin kıyaslanması, etkenlerin antimikrobiyal direnç sürveyansı.